分子相關(guān)實(shí)驗(yàn),需要保證實(shí)驗(yàn)室的潔凈。定期清潔實(shí)驗(yàn)室,有利于提高實(shí)驗(yàn)結(jié)果的穩(wěn)定性。
過(guò)氧化物酶Pex5、Pex13和Pex14在過(guò)氧化物酶體靶向信號(hào)1 (PTS1)通路的蛋白易位步驟中起關(guān)鍵作用。Pex5通過(guò)識(shí)別PTS1基序(羧基端三肽序列絲氨酸-賴氨酸-亮氨酸(SKL)或其變體)與細(xì)胞質(zhì)中的貨物蛋白結(jié)合。貨物結(jié)合時(shí)的構(gòu)象改變暴露了一個(gè)內(nèi)在無(wú)序區(qū)(IDR),該區(qū)域與過(guò)氧化物酶體膜蛋白Pex13和Pex14相互作用,導(dǎo)致貨物蛋白易位到過(guò)氧化物酶體基質(zhì)。
在過(guò)氧化物酶體中沒(méi)有觀察到通道結(jié)構(gòu),也沒(méi)有驗(yàn)證過(guò)運(yùn)輸?shù)奈锢砟P停峁┝艘恍┳C據(jù),證明至少是瞬時(shí)形成的通道。在一項(xiàng)體外研究中,用Pex14復(fù)合物重建的脂質(zhì)膜在直徑達(dá)9納米的貨物中顯示出pex5 -貨物依賴的離子電導(dǎo)。
Pex5、Pex13和Pex14中idr的序列特征類似于核孔復(fù)合物(npc)的核孔蛋白,這為可能的轉(zhuǎn)運(yùn)機(jī)制提供了線索。值得注意的是,Pex13在其IDR中具有一系列Tyr-Gly (YG)重復(fù)序列。
研究人員推斷這些殘基可能通過(guò)π -π或π -陽(yáng)離子相互作用發(fā)生LLPS,類似于核孔蛋白中ph - gly (FG)重復(fù)序列形成的LLPS,并構(gòu)成NPC的選擇性滲透性過(guò)濾器;我們假設(shè)產(chǎn)生的凝聚形成了一個(gè)簡(jiǎn)單的、原始的、瞬態(tài)的類似npc的集合。
相關(guān)研究發(fā)表在《Nature》上,文章標(biāo)題為“Peroxisome biogenesis initiated by protein phase separation"。
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這一假設(shè)為蛋白質(zhì)進(jìn)入過(guò)氧化物酶體提供了一種自然的解釋,過(guò)氧化物酶通過(guò)LLPS形成生物分子凝聚物,并為貨物通過(guò)過(guò)氧化物酶體膜運(yùn)輸創(chuàng)造了一個(gè)短暫的管道,Pex5類似于核細(xì)胞蛋白充當(dāng)穿梭受體。出芽酵母酵母S. cerevisiae Pex13在其IDR中具有芳香重復(fù)序列,Pex5和Pex13在其IDR中具有明顯的朊病毒樣結(jié)構(gòu)域(PLDs),這些結(jié)構(gòu)域已被證明通過(guò)多價(jià)π -π或π -陽(yáng)離子“貼紙"相互作用形成生物分子凝聚物。
事實(shí)上,在ATP耗竭的情況下,過(guò)氧化物酶體蛋白以大型復(fù)合物的形式沉淀,這表明它們的形成先于易位。因此,研究人員開(kāi)始驗(yàn)證過(guò)氧化物酶體蛋白轉(zhuǎn)運(yùn)通過(guò)Pex5-cargo-Pex13-Pex14 LLPS發(fā)生的假設(shè)。
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